連接兩個氨基酸分子的化學鍵叫做

生物里叫肽鍵，化學里叫酰胺鍵。兩分子氨基酸縮合成為二肽，二肽仍有自由α-氨基和α-羧基,能同樣借肽鍵與其他氨基酸縮合成三肽，相同的反應可繼續進行。

肽鍵中的C—N鍵的鍵長短于C=N鍵長，長于一般C—N鍵的鍵長；肽鍵中的C一N鍵具有部分雙鍵性質，不能自由旋轉。

肽鍵平面中除C一N鍵不能旋轉外，兩側的C一N和C一C。鍵均為鍵，因而相鄰的肽鍵平面可圍繞C。旋轉，肽鏈的主鏈骨架也可視為由一系列通過C。

原子銜接的肽鍵平面所組成，肽鍵平面的旋轉所產生的立體結構可呈現多種狀態，從而導致蛋白質分子呈各種不同的構象。肽鏈中的自由氨基、羧基及殘基側鏈的其它基團可發生與氨某酸中相應基團相類似的化學反應。